变形菌门（Proteobacteria）是细菌中最大的一门，包括很多病原菌，如大肠杆菌、<a href="./?mention=沙门氏菌">沙门氏菌</a>、<a href="./?mention=霍乱弧菌">霍乱弧菌</a>、<a href="./?mention=幽门螺杆菌">幽门螺杆菌</a>等著名的种类。也有自由生活的种类，包括很多可以进行<a href="./?mention=固氮">固氮</a>的细菌。变形菌门主要是由<a href="./?mention=核糖体">核糖体</a><a href="./?mention=RNA">RNA</a>序列定义的，名称取自希腊神话中能够变形的神<a href="./?mention=普罗透斯">普罗透斯</a>（这同时也是变形菌门中<a href="./?mention=变形杆菌属">变形杆菌属</a>的名字），因为该门细菌的形状具有极为多样的形状。