食品工程学院始建于1958年。下设食品工程教研室、食品安全教研室、生物工程教研室、环境工程教研室和化学教研室；食品工程研究所；省高校食品基础化学实验教学示范中心和分析检测中心；<a href="./?mention=食品科学与工程">食品科学与工程</a>实验室。拥有“食品科学与工程”、“生物工程”、“食品质量与安全”、“环境工程”4个本科专业， 一个“<a href="./?mention=食品科学">食品科学</a>”二级学科博士学位授权点，一个“食品科学与工程”一级学科硕士学位授权点和一个“<a href="./?mention=发酵工程">发酵工程</a>”二级学科硕士学位授权点。1996年，食品科学学科被<a href="./?mention=国内贸易部">国内贸易部</a>确认为部级重点学科，2000年又被<a href="./?mention=黑龙江省">黑龙江省</a>评定为省级重点学科。