结合<a href="./?mention=蛋白质">蛋白质</a>的分子中除<a href="./?mention=氨基酸">氨基酸</a>组分之外，还含有非氨基酸物质，后者称为<a href="./?mention=辅因子">辅因子</a>，二者以共价或非共价形式结合，往往作为一个整体从生物材料中被分离出来。<a href="./?mention=单纯蛋白质">单纯蛋白质</a>是指分子组成中，除氨基酸构成的多肽蛋白成分外，没有任何非蛋白成分称为单纯蛋白质。自然界中的许多蛋白质属于此类。而结合蛋白质是单纯蛋白质和其他化合物结合构成，被结合的其他化合物通常称为结合蛋白质的非蛋白部分(辅基)。按其非蛋白部分的不同而分为<a href="./?mention=核蛋白">核蛋白</a>(含核酸)、<a href="./?mention=糖蛋白">糖蛋白</a>(含多糖)、<a href="./?mention=脂蛋白">脂蛋白</a>(含脂类)、磷蛋白(含磷酸)、<a href="./?mention=金属蛋白">金属蛋白</a>(含金属)及<a href="./?mention=色蛋白">色蛋白</a>(含色素)等。